MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xenorhabdus nematophila ATCC 19061 chromosome

Total Repeats: 89225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014228	CT	3	6	3	8	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014228	GAT	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014228	GAG	2	6	78	83	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014228	TAT	2	6	112	117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014228	GCA	2	6	175	180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721090
6	NC_014228	CT	3	6	273	278	0 %	50 %	0 %	50 %	300721090
7	NC_014228	AG	3	6	311	316	50 %	0 %	50 %	0 %	300721090
8	NC_014228	AT	3	6	319	324	50 %	50 %	0 %	0 %	300721090
9	NC_014228	TAA	2	6	325	330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300721090
10	NC_014228	TTA	2	6	341	346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300721090
11	NC_014228	TGC	2	6	375	380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721090
12	NC_014228	ACAT	2	8	547	554	50 %	25 %	0 %	25 %	300721090
13	NC_014228	TTG	2	6	564	569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300721090
14	NC_014228	CCAA	2	8	579	586	50 %	0 %	0 %	50 %	300721090
15	NC_014228	GCC	3	9	596	604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300721090
16	NC_014228	G	6	6	625	630	0 %	0 %	100 %	0 %	300721090
17	NC_014228	CAT	2	6	706	711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300721090
18	NC_014228	AGT	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721090
19	NC_014228	AGA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300721090
20	NC_014228	TTA	2	6	814	819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300721090
21	NC_014228	CTG	2	6	836	841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721090
22	NC_014228	GAT	2	6	845	850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721090
23	NC_014228	T	6	6	857	862	0 %	100 %	0 %	0 %	300721090
24	NC_014228	AAG	2	6	882	887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300721090
25	NC_014228	CTG	2	6	911	916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721090
26	NC_014228	ATT	2	6	932	937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300721090
27	NC_014228	TGA	2	6	1059	1064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721090
28	NC_014228	TTC	2	6	1109	1114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300721090
29	NC_014228	TGCCAA	2	12	1174	1185	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300721090
30	NC_014228	CCGG	2	8	1191	1198	0 %	0 %	50 %	50 %	300721090
31	NC_014228	ATA	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300721090
32	NC_014228	AATGGC	2	12	1366	1377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300721090
33	NC_014228	TGG	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300721090
34	NC_014228	CA	3	6	1442	1447	50 %	0 %	0 %	50 %	300721090
35	NC_014228	GAA	2	6	1487	1492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300721090
36	NC_014228	AGA	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300721090
37	NC_014228	TCA	2	6	1558	1563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300721091
38	NC_014228	ATT	2	6	1577	1582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300721091
39	NC_014228	AGC	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721091
40	NC_014228	GCC	2	6	1618	1623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300721091
41	NC_014228	TTA	2	6	1647	1652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300721091
42	NC_014228	CTG	3	9	1674	1682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721091
43	NC_014228	GAC	2	6	1908	1913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721091
44	NC_014228	TAT	2	6	2007	2012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300721091
45	NC_014228	ACGG	2	8	2064	2071	25 %	0 %	50 %	25 %	300721091
46	NC_014228	CTG	2	6	2166	2171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721091
47	NC_014228	GGC	2	6	2175	2180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300721091
48	NC_014228	GCA	2	6	2206	2211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721091
49	NC_014228	ATTTT	2	10	2236	2245	20 %	80 %	0 %	0 %	300721091
50	NC_014228	CCG	2	6	2282	2287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300721091
51	NC_014228	A	6	6	2297	2302	100 %	0 %	0 %	0 %	300721091
52	NC_014228	CAA	2	6	2432	2437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300721091
53	NC_014228	GAA	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300721091
54	NC_014228	GAA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300721091
55	NC_014228	CTG	2	6	2565	2570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721091
56	NC_014228	TGT	2	6	2627	2632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300721091
57	NC_014228	A	6	6	2650	2655	100 %	0 %	0 %	0 %	300721091
58	NC_014228	CATA	2	8	2678	2685	50 %	25 %	0 %	25 %	300721092
59	NC_014228	TC	3	6	2690	2695	0 %	50 %	0 %	50 %	300721092
60	NC_014228	GCA	2	6	2842	2847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721092
61	NC_014228	ATTC	2	8	2885	2892	25 %	50 %	0 %	25 %	300721092
62	NC_014228	CAA	2	6	2910	2915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300721092
63	NC_014228	GGC	2	6	2961	2966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300721092
64	NC_014228	TGC	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721092
65	NC_014228	GGC	2	6	3069	3074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300721092
66	NC_014228	TCG	2	6	3083	3088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721092
67	NC_014228	ATTG	2	8	3096	3103	25 %	50 %	25 %	0 %	300721092
68	NC_014228	GCT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721092
69	NC_014228	T	6	6	3129	3134	0 %	100 %	0 %	0 %	300721092
70	NC_014228	GCT	2	6	3158	3163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721092
71	NC_014228	GCA	2	6	3177	3182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721092
72	NC_014228	CAA	2	6	3351	3356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300721092
73	NC_014228	AG	3	6	3368	3373	50 %	0 %	50 %	0 %	300721092
74	NC_014228	CG	3	6	3392	3397	0 %	0 %	50 %	50 %	300721092
75	NC_014228	TG	3	6	3523	3528	0 %	50 %	50 %	0 %	300721092
76	NC_014228	TGA	2	6	3593	3598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721092
77	NC_014228	GCCG	2	8	3618	3625	0 %	0 %	50 %	50 %	300721092
78	NC_014228	TGAT	2	8	3709	3716	25 %	50 %	25 %	0 %	300721092
79	NC_014228	AGA	2	6	3740	3745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300721092
80	NC_014228	CTC	2	6	3812	3817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300721093
81	NC_014228	GAT	2	6	3885	3890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721093
82	NC_014228	GTT	2	6	3921	3926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300721093
83	NC_014228	CGA	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721093
84	NC_014228	CCAT	2	8	3979	3986	25 %	25 %	0 %	50 %	300721093
85	NC_014228	GAT	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721093
86	NC_014228	GAA	3	9	4044	4052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300721093
87	NC_014228	GCG	2	6	4062	4067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300721093
88	NC_014228	TGC	2	6	4084	4089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721093
89	NC_014228	G	7	7	4094	4100	0 %	0 %	100 %	0 %	300721093
90	NC_014228	CGG	2	6	4130	4135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300721093
91	NC_014228	TGT	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300721093
92	NC_014228	CGT	2	6	4197	4202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721093
93	NC_014228	CAT	2	6	4230	4235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300721093
94	NC_014228	TTG	2	6	4468	4473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300721093
95	NC_014228	T	6	6	4513	4518	0 %	100 %	0 %	0 %	300721093
96	NC_014228	ATG	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721093
97	NC_014228	CAA	2	6	4604	4609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300721093
98	NC_014228	ACA	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300721093
99	NC_014228	A	6	6	4704	4709	100 %	0 %	0 %	0 %	300721093
100	NC_014228	TGA	2	6	4730	4735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721093
101	NC_014228	TTC	2	6	4817	4822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300721093
102	NC_014228	CGG	2	6	4834	4839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300721093
103	NC_014228	TGA	2	6	4849	4854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721093
104	NC_014228	TGG	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300721093
105	NC_014228	CTG	2	6	4875	4880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721093
106	NC_014228	ACG	2	6	4891	4896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721093
107	NC_014228	CGT	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721093
108	NC_014228	TGG	2	6	5059	5064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300721093
109	NC_014228	GGT	2	6	5079	5084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300721093
110	NC_014228	CT	3	6	5178	5183	0 %	50 %	0 %	50 %	300721093
111	NC_014228	TGA	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721093
112	NC_014228	CAT	4	12	5270	5281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300721093
113	NC_014228	CCGATG	2	12	5284	5295	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300721093
114	NC_014228	CTG	3	9	5319	5327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721093
115	NC_014228	CTT	2	6	5330	5335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300721093
116	NC_014228	CCA	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300721093
117	NC_014228	GAA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300721093
118	NC_014228	GCG	2	6	5484	5489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300721093
119	NC_014228	CATC	2	8	5573	5580	25 %	25 %	0 %	50 %	300721093
120	NC_014228	CTG	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721093
121	NC_014228	GAA	2	6	5673	5678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300721093
122	NC_014228	GC	3	6	5686	5691	0 %	0 %	50 %	50 %	300721093
123	NC_014228	GCA	2	6	5725	5730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721093
124	NC_014228	GATTTC	2	12	5826	5837	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	300721093
125	NC_014228	CCG	2	6	5855	5860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300721093
126	NC_014228	TGAT	2	8	5893	5900	25 %	50 %	25 %	0 %	300721093
127	NC_014228	AT	3	6	5909	5914	50 %	50 %	0 %	0 %	300721093
128	NC_014228	GTG	2	6	5920	5925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300721093
129	NC_014228	AGC	2	6	5943	5948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721093
130	NC_014228	TCCA	2	8	5997	6004	25 %	25 %	0 %	50 %	300721093
131	NC_014228	AAC	2	6	6050	6055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300721093
132	NC_014228	CGT	2	6	6072	6077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721093
133	NC_014228	ATG	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721093
134	NC_014228	CTG	2	6	6117	6122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721093
135	NC_014228	TCG	2	6	6155	6160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300721093
136	NC_014228	GAA	2	6	6171	6176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300721093
137	NC_014228	AGC	2	6	6188	6193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721093
138	NC_014228	ATCC	2	8	6230	6237	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014228	A	7	7	6263	6269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014228	ATT	2	6	6273	6278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300721094
141	NC_014228	ATA	2	6	6299	6304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300721094
142	NC_014228	TCT	2	6	6312	6317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300721094
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144	NC_014228	ATT	3	9	6517	6525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300721094
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146	NC_014228	TATT	2	8	6608	6615	25 %	75 %	0 %	0 %	300721094
147	NC_014228	TGT	2	6	6684	6689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300721094
148	NC_014228	T	6	6	6700	6705	0 %	100 %	0 %	0 %	300721094
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152	NC_014228	TTAAA	2	10	6907	6916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014228	A	6	6	6914	6919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014228	ATTT	2	8	6986	6993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014228	CAA	2	6	7007	7012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_014228	ATAA	2	8	7072	7079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014228	A	6	6	7096	7101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014228	TCA	2	6	7103	7108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014228	TCA	2	6	7148	7153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_014228	GCA	2	6	7243	7248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721095
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162	NC_014228	T	6	6	7281	7286	0 %	100 %	0 %	0 %	300721095
163	NC_014228	GCTT	2	8	7342	7349	0 %	50 %	25 %	25 %	300721095
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166	NC_014228	T	6	6	7406	7411	0 %	100 %	0 %	0 %	300721095
167	NC_014228	TTCA	2	8	7422	7429	25 %	50 %	0 %	25 %	300721095
168	NC_014228	TCAG	2	8	7596	7603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_014228	TTA	2	6	7620	7625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014228	TAATT	2	10	7639	7648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014228	A	6	6	7670	7675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014228	AT	3	6	7691	7696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014228	TAT	2	6	7699	7704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014228	TCT	2	6	7705	7710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_014228	AAC	2	6	7747	7752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_014228	AC	3	6	8065	8070	50 %	0 %	0 %	50 %	300721096
179	NC_014228	ATT	2	6	8091	8096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300721096
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196	NC_014228	TAA	2	6	9056	9061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_014228	ATG	2	6	9092	9097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
198	NC_014228	A	6	6	9099	9104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_014228	CAG	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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215	NC_014228	ATA	2	6	9691	9696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_014228	AAC	2	6	9884	9889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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232	NC_014228	CAA	2	6	10114	10119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_014228	ATC	2	6	10202	10207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300721101
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259	NC_014228	T	7	7	11338	11344	0 %	100 %	0 %	0 %	300721101
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263	NC_014228	ATACCA	2	12	11574	11585	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	300721101
264	NC_014228	ATG	2	6	11618	11623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721101
265	NC_014228	TC	3	6	11634	11639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
266	NC_014228	TGC	2	6	11671	11676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_014228	T	6	6	11693	11698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_014228	TGC	2	6	11711	11716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_014228	T	6	6	11733	11738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_014228	TGC	2	6	11751	11756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_014228	T	6	6	11773	11778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_014228	AGGT	2	8	11832	11839	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
273	NC_014228	ATT	2	6	11876	11881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_014228	GTTA	2	8	11887	11894	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
275	NC_014228	A	6	6	11929	11934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_014228	TAT	2	6	11950	11955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_014228	AT	3	6	11963	11968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_014228	TAA	2	6	11991	11996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_014228	TACA	2	8	12019	12026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
280	NC_014228	AT	3	6	12052	12057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014228	TTA	2	6	12092	12097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014228	AGTT	2	8	12107	12114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014228	T	7	7	12141	12147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_014228	TCT	2	6	18179	18184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300721107
403	NC_014228	CGGT	2	8	18227	18234	0 %	25 %	50 %	25 %	300721107
404	NC_014228	GCCA	2	8	18281	18288	25 %	0 %	25 %	50 %	300721107
405	NC_014228	AAT	2	6	18328	18333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300721107
406	NC_014228	T	7	7	18358	18364	0 %	100 %	0 %	0 %	300721107
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408	NC_014228	GAC	2	6	18393	18398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721107
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410	NC_014228	AATT	2	8	18439	18446	50 %	50 %	0 %	0 %	300721107
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427	NC_014228	CAGT	2	8	19011	19018	25 %	25 %	25 %	25 %	300721107
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432	NC_014228	AC	3	6	19599	19604	50 %	0 %	0 %	50 %	300721108
433	NC_014228	TGT	2	6	19711	19716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300721108
434	NC_014228	TC	3	6	19785	19790	0 %	50 %	0 %	50 %	300721108
435	NC_014228	T	6	6	19813	19818	0 %	100 %	0 %	0 %	300721108
436	NC_014228	CA	3	6	19830	19835	50 %	0 %	0 %	50 %	300721108
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439	NC_014228	T	6	6	19904	19909	0 %	100 %	0 %	0 %	300721108
440	NC_014228	TAG	2	6	19912	19917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300721108
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473	NC_014228	GCA	2	6	21385	21390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300721109
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